南京商业学校在管理体制建设探索的过程中，初步设计建构的具体模式可以概括表述为“三责并立、三位一体”：“三责并立”，指在校长室的统一领导和指挥下，系部“承办”，负办学主体责任；处室“考核”，负办学主导责任；教学诊断与评估中心进行“诊断与评估”，负办学“主线责任”。三类部门，三种权力责任相对独立；“三位一体”，指系部、处室、教学诊断与评估中心这三个方面是既相互独立又相互依存的不可分割的统一整体，又是在校长室的统一领导领导和指挥下，心往一处想，劲往一处使，同心同德的战斗集体和管理服务团队。

“三责并立、三位一体”的行政结构，是对实现职业教育治理现代化转型的内部路径的积极探索，是一种以校长室为枢纽的职能处室执行模式，既区别于高职院校高效管理模式，又具有南京商业学校的运行特色。